Le Conseil du Jura bernois (CJB) entre officiellement en fonction le 1er juin 2006. Il succède au Conseil régional Jura bernois et Bienne romande conformément à la loi sur le statut particulier du Jura entrée en vigueur le 1er janvier 2006.

Les 24 premiers membres du CJB (11 pour le district de Moutier, 10 pour Courtelary, 3 pour La Neuveville) sont élus le week-end du 8-9 avril 2006, pour une durée de quatre ans. Les membres du CJB ne peuvent être en même temps membres du Conseil-exécutif. Leurs compétences concernent principalement l'octroi des subventions culturelles et la coordination dans le domaine de la formation à l'échelon romand. Le Bureau est composé d'un·e président·e, d'un·e vice-président·e et de deux membres.

Les deuxièmes élections ont lieu le 28 mars 2010. Le CJB reste alors à majorité antiséparatiste. La grande gagnante est l'UDC avec 2 sièges en plus (de 5 à 7), et un siège pour le PBD. Le PS et AJU perdent chacun un siège alors que les Verts font leur entrée avec deux élus. Le PLR perd quant à lui deux sièges.

Les élections du 4 juin 2014 se résument par le gain d’un siège pour l’UDC (de 7 à 8) et de deux pour le groupe socialiste (de 4 à 6). Le groupe autonome et les Verts perdent chacun un siège (de 6 à 5 pour le groupe autonome, et de 2 à 1 pour les Verts). Le parti évangélique conserve son unique siège et le parti bourgeois-démocratique n’est plus représenté, ne disposant plus de son seul siège de la précédente législature.

Les résultats pour la législature 2018-2022, dont la séance constitutive se tient le 6 juin 2018, se soldent par la perte de deux sièges pour l’UDC (désormais 7), d’un siège pour le groupe PS (5), d’un siège également pour le groupe autonome (4), le gain de trois sièges pour le groupe PLR et de deux sièges pour les Verts. Le parti évangélique perd son unique siège et n’est donc plus représenté.

En mars 2011, le CJB remet pour la première fois les « distinctions pour mérites exceptionnels dans le domaine de la culture », qu’il peut octroyer au maximum trois fois par législature selon le règlement adopté le 28 avril 2010. Les trois premiers lauréats sont Antoine Joly (clarinettiste), Laurence Marti (sociologue et historienne) et Ivan Vecchi (co-initiateur de la Bibliothèque des jeunes de Tavannes, très engagé au sein du Royal à Tavannes).

En juin 2013, c'est l'écrivaine Sylviane Chatelain qui est distinguée par le premier Prix des arts, des lettres et des sciences du Conseil du Jura bernois, qui n'est lui aussi remis qu'une fois par législature (2010-2014). Pour la législature 2014-2018, le Prix des arts, des lettres et des sciences revient à Lucienne Lanaz, cinéaste, tandis que pour la législature 2018-2022, c'est Esther-Lisette Ganz, peintre et sculptrice, qui en est la lauréate.

Président·e·s

• 2006-2007 : Jean-Jacques Schumacher
• 2007-2008 : Jean-Michel Blanchard
• 2008-2009 : Jean-Pierre Aellen
• 2009-2010 : Francis Daetwyler
• 2010-2011 : Willy Sunier
• 2011-2012 : Manfred Bühler
• 2012-2013 : Jean-Pierre Aellen
• 2013-2014 : Christophe Gagnebin
• 2014-2015 : Willy Sunier
• 2015-2016 : Pierre-Alain Schnegg
• 2016-2017 : Maurane Riesen
• 2017-2018 : Marcelle Forster
• 2018-2019 : Roland Benoit
• 2019-2020 : Morena Pozner
• 2020-2021 : Virginie Heyer
• 2021-2022 : Virginie Heyer
• 2022-2023 : Cyprien Louis
• 2023-2024 : Etienne Klopfenstein
• 2024-2025 : Elisabeth Beck

Secrétaires généraux

• 2006 : Patrick Gsteiger, a.i.
• 2007-2014 : Fabian Greub
• 2015-2017 : Lucas Bonadei
• 2018-2023 : Kim Seiler
• 2023- : Jessica Schöpfer

Répartition des partis

Elections 2006

• Parti socialiste : 5
• Parti radical-démocratique : 5
• Union démocratique du centre : 5
• Parti socialiste autonome : 4
• Alliance jurassienne : 2
• Parti évangélique : 1
• Parti démocrate-chrétien - Parti libéral jurassien : 1
• Alliance hors parti du district de La Neuveville (AHPDN) : 1

Elections 2010

• Union démocratique du centre : 7
• Parti socialiste : 4
• Parti socialiste autonome : 4
• Parti libéral radical : 3
• Verts : 2
• Alliance jurassienne : 1
• Parti évangélique : 1
• Parti démocrate-chrétien : 1
• Parti bourgeois démocratique : 1

Elections 2014

• Union démocratique du centre : 8
• Parti socialiste : 6
• Parti socialiste autonome : 4
• Parti libéral radical : 3
• Verts : 1
• Parti évangélique : 1
• Entente PDC - MLJ : 1

Elections 2018

• Union démocratique du centre : 7
• Parti libéral radical : 5
• Parti socialiste : 5
• Verts : 3
• Parti socialiste autonome : 4

Elections 2022

• Groupe UDC – UDF : 9
• Socialistes et Centre : 5
• Vert·e·s – PEV : 4
• PLR : 3
• PS : 3  

Membres par district

Moutier

• Paolo Annoni, PRJB, 2006-2009
• Jean-Pierre Aellen, PSA, 2006-2018
• Sylvain Astier, PRD, 2006 (démissionnaire au 1er décembre 2006, remplacé par Paolo Annoni)
• Jean-Michel Blanchard, UDC, 2006-2018
• Véronique Cabrio, PSA, 2008-2010
• Marcelle Forster-Boivin, PS, 2006-2018
• Hubert Frainier, PDC-PLJ, 2006-2014
• Jacques Frei, PDC, 2018-2022
• Bernard Gafner, UDF, 2022-
• Peter Gasser, PSA, 2010-
• Pierre-André Geiser, UDC, 2006-2010
• Tom Gerber, PEV, 2006-2017
• Valentine Gerber, UDC, 2016-2021
• Manuel Gsteiger, PEV, 2017 (n'a jamais siégé, remplacé d'entrée par Jean-Marc Knuchel)
• Patrick Gsteiger, PEV, 2006 (n'a jamais siégé, remplacé d'entrée par Tom Gerber)
• Virginie Heyer, PLR, 2018-
• Irma Hirschi, PSA, 2010 (n'a jamais siégé, remplacé d'entrée par Pierre Mercerat)
• Jean-Marc, Knuchel, PEV, 2017-2018 ; 2022-
• André Mercerat, PLR, 2009-2010 ; 2012-
• Pierre Mercerat, PSA, 2006-2022 (non réélu en 2010, il remplace cependant Irma Hirschi qui renonce à siéger)
• Jean-René Moeschler, PSA, 2006-2014
• Jean-Luc Niederhauser, PLR, 2018-2022
• Maxime Ochsenbein, UDC, 2016-
• Morena Pozner, PS, 2015-
• Sandra Roulet Romy, PS, 2014-2015
• Daniel Schaer, UDC, 2010 (remplacé d'entrée par Naomi Schnegg)
• Michael Schlappach, UDC, 2021-
• Naomi Schnegg, UDC, 2010-2014
• Pierre-Alain Schnegg, UDC, 2014-2016 (remplacé par Valentine Gerber)
• Jean-Jacques Schumacher, PRD, 2006-2012
• Marc Tobler, UDC, 2010-2016
• Patrick Tobler, UDC, 2018-
• Enrico Tolotti, PSA, 2006-2008 (démissionne, remplacé par Véronique Cabrio)
• Christian Vaquin, Entente PDC-PLJ, 2006 (n'a jamais siégé, remplacé d'entrée par Hubert Frainier)
• Marcel Winistoerfer, Entente PDC-MLJ, 2014-2018 ; Le Centre, 2022-
• Valentin Winistoerfer, PSA, 2022-
• Marina Zuber, PSA, 2022-
• Maxime Zuber, PSA, 2006 (démissionne le 21 avril 2006, remplacé par Jean-René Moeschler); 2010 (renonce à siéger au profit de Peter Gasser)

Courtelary

• Elisabeth Beck, PS, 2018-
• Roland Benoit, UDC, 2014-
• Antoine Bigler, PS, 2006-2018
• Stéphane Boillat, AJU, 2006-2014
• Manfred Bühler, UDC, 2006-2015 ; 2022-
• Daniel Chaignat, AJU, 2006-2010; Verts, 2010-2014
• Mathieu Chaignat, Verts JB, 2014-2022
• Francis Daetwyler, PS, 2006-2018
• Fritz Fankhauser, UDC, 2008-2010
• Christophe Gagnebin, PS, 2006-2022
• Denis Gerber, PLR, 2018-2022
• Hervé Gullotti, PS, 2022-
• Dave von Kaenel, PLR, 2018-2021
• Walter von Kaenel, PRD, 2006-2018
• Etienne Klopfenstein, UDC, 2010-
• Jean-Pierre Rérat, PRD, 2006-2010
• Maurane Riesen, PSA, 2014-2021
• François Roquier, Les Verts, 2022-
• Michel Ruchonnet, PS, 2018-2022
• Beat Scheidegger, UDC, 2010-2018
• Fred-Henri Schnegg, UDC, 2006-2008 (démissionne en 2008, remplacé par Fritz Fankhauser)
• Michel Tschan, UDC, 2016-
• Annelise Vaucher, UDC, 2006-2010; PBD, 2010-2014
• Moussia von Wattenwyl, Verts JB, 2018-

La Neuveville

• Denise Bloch-Bertoli, PS, 2018-
• Martine Gallaz, PS, 2006-2010 ; 2014-2018
• Anne-Caroline Graber, UDC, 2010-2014
• François Gauchat, PLR, 2018-
• Nicole Hofer, Verts, 2010-2014
• Didier Lecomte, UDC, 2014-2018
• Cyprien Louis, Verts JB, 2018-
• Roland Matti, PLR, 2022-
• Francis Membrez, AHPDN, 2006-2010
• Willy Sunier, PRD, 2006-2018