Originaire de Drei Höfe (SO). Né à Delémont le 23 août 1957. Fils de Max Winistoerfer, employé de commerce, et de Thérèse Winistoerfer, née Meier, mère au foyer. Epouse Pepita Winistoerfer, née Bianchi, mère au foyer, un fils. Catholique.
Après sa scolarité, W. obtient un brevet d'instituteur à l'Ecole normale de Porrentruy (1973-1977), suivi par le brevet secondaire à l’Université de Berne (1978–1982) et un brevet d’enseignant spécialisé à l’École normale de Neuchâtel (1993-1995). Il travaille comme enseignant aux écoles primaires de Moutier et Perrefitte de 1982 à 1993 et dès lors comme enseignant à l’École secondaire de Moutier.
En vue des élections communales de Moutier en 2006, W. adhère au Parti démocrate-chrétien (PDC) et devient Conseiller de Ville pour la législature 2007-2010, ainsi que président du Conseil en 2009 (à l'instar de son père qui en a été le président en 1978). Il est ensuite élu au Conseil municipal et s'y occupe du dicastère culture, sports, loisirs et jeunesse de 2011 à 2016. Il devient membre du Conseil du Jura bernois CJB pour la législature 2014-2018. Porte-parole du comité «Moutier, ville jurassienne» et soutenu par tout les partis de l'Entente jurassienne, W. est élu maire de Moutier le 5 juin 2016 en l'emportant sur son rival sans parti et pro-bernois Francis Pellaton et en succédant à Maxime Zuber, qui quitte la mairie après 22 ans. W. est le premier maire PDC de Moutier.
Membre du FC Moutier dès 1968, en tant que joueur pendant plus de 40 ans et puis en tant qu’entraîneur au niveau des juniors A pendant une dizaine d'années.
Au militaire, W. est soldat fusilier.