La Commission intercantonale de littérature (CiLi) est instituée en décembre 2008 par un accord entre le canton de Berne et la République et Canton du Jura entré en vigueur le 1^er janvier 2009. Composée de cinq membres, la CiLi remplace désormais les anciennes Commission pour l’encouragement des lettres jurassiennes et Commission de littérature de langue française du canton de Berne. En 2016, le nombre des membres de la commission est augmenté de 5 à 7.
Son but est de promouvoir les auteurs francophones ayant un lien étroit avec les deux cantons ou plus largement avec l’Arc jurassien. Deux prix doivent être décernés tous les deux ans, le Prix Renfer, pour l’ensemble d’une oeuvre, et le Prix Alpha, pour une publication en particulier. Outre les contributions cantonales ordinaires, les prix sont alimentés par un don privé, le Fonds Jeanne Fell-Doriot (veuve de René Fell).
En 2011, la CiLi décerne ses premiers prix, soit le Prix Renfer à l’écrivain français de Besançon Yves Ravey et le Prix Alpha à l’écrivaine valaisanne établie à Bienne Noëlle Revaz. Dès 2011, les prix sont remis lors des Journées littéraires de Soleure.
En 2012, deux bourses dotées par le Fonds Fell-Doriot, l'une d'aide à l'écriture, l'autre pour l'encouragement de la recherche, sont attribuées pour encourager de jeunes auteurs, étudiants ou chercheurs dans le domaine de la littérature jurassienne. Elle seront attribuées tous les deux ans en alternance avec les deux prix. Ces dernier se voient quelque peu modifiés en 2019 : le prix Renfer devient le Grand Prix de littérature, tandis que le prix Alpha est renommé Prix de littérature.
Le premier président de la CiLi est Arnaud Buchs (2009-2014), suivi par Valérie Meylan (2015-2019) puis Livia Lüthi (dès 2020).

Prix Renfer/Grand Prix de littérature
2011 Yves Ravey (Besançon, F)
2013 Pierre Chappuis
2015 Alexandre Voisard
2017 Jean-Bernard Vuillème
2019 Daniel de Roulet
2021 Bernard Comment

Prix Alpha/Prix de littérature
2011 Noëlle Revaz, pour son roman Efina (Gallimard, 2009)
2013 Isabel Ascencio (Arbois, F), pour son roman Drama Queen (éditions Verticales, 2012)
2015 pas attribué
2017 Elisa Shua Dusapin
2019 Thomas Sandoz
2021 Julie Guinand (La Chaux-de-Fonds), pour Survivante, et Alexandre Lecoultre (Berne) pour Peter und so weiter

Bourses Fell-Doriot d'aide à l'écriture
2012 non attribué
2014 Gaia Grandin
2016 José Gsell
2018 Myriam Wahli
2021 Antoine Rubin

Bourses Fell-Doriot pour la recherche
2021 Dictionnaire du Jura (DIJU)

Bourse spéciale
2021 Thomas Flahaut.