Ouvert en 1970, le Musée du Löwenbourg se situe dans le bâtiment de l'ancienne fromagerie du domaine situé sous le château du Löwenbourg (commune de Pleigne, JU). 'Les ruines du château et de la grange sont achetées en 1956 par la Fondation Christoph Merian de Bâle puis entièrement restaurées de 1963-1966. Depuis, les bâtiments dépendent de la protection des monuments et sites. 'Pendant les travaux de rénovation, des fouilles ont permis de faire certaines découvertes notamment sur l'histoire de la construction du château.
Le petit musée historique est remanié au milieu des années 1990 et présente aujourd'hui deux expositions permanentes. Dans l'ancienne cave à fromage, on trouve des objets préhistoriques découverts dans une carrière à silex toute proche ainsi que des fossiles et des informations géologiques ; au premier étage se trouvent des objets du Moyen Age découverts lors des fouilles autour du château (catelles de poêles, armes, matériel de chasse et outils de travail, une bouilloire et un précieux sceau) ainsi que des maquettes et des plans qui retracent l'histoire du château et de la vie au Löwenbourg.' Dans la ferme et sur le domaine alentour, la Fondation Christoph Merian s'occupe d'une des plus grandes fermes biologiques de Suisse.