JURA

- Musée du Château d'Asuel (Schlossmuseum, Asuel)
Das Museum ist in einem kleinen Fachwerkhaus aus dem 18. Jh. unterhalb der Ruine des Schlosses von Asuel untergebracht. Es präsentiert eine Ausstellung über die Entwicklung und die Bauart der Schlösser im Jura, insbesondere des Schlosses von Asuel (mit einem Modell der Anlage).
- Mont Repais-Museum, Asuel
- Jurassisches Museum für Kunst und Geschichte, Delsberg
- Musée Chappuis-Fähndrich, Develier
- Museum auf der Löwenburg, Pleigne
- Musée de la Boîte de Montre (Uhrgehäusemuseum), Le Norimont
- Jurassisches Ackerbaumuseum, Les Genevez
Das Museum ist seit 1982 geöffnet und befindet sich in einem Doppelbauernhof aus dem 16. Jh. Es zeigt die Wohnungen zweier Bauernfamilien aus vergangenen Jahrhunderten.
- Musée agricole des Vieilles Traditions, Grandfontaine
- Centre Nature Les Cerlatez
- Automuseum, Muriaux
- Musée de l'Hôtel-Dieu, Pruntrut
- Musée jurassien des sciences naturelles, Pruntrut
- Steinmuseum, Saint-Ursanne
- L'Arche de Noé, Vicques
Die Arche de Noé (Arche Noah) in Vicques zeigt die grösste Privatsammlung ausgestopfter Tiere in der Schweiz.
- Museum des früheren Handwerks, Fahy
Fuhrwerke, altes Spielzeug, verschiedene Handwerkstraditionen aus früheren Zeiten: Stellmacher, Seiler, Schuster, Schnapsbrenner, Schmied, Holzschumacher, Böttcher, Korbflechter.
- Töpfereimuseum, Bonfol

BERNER JURA

- Tête de Moine-Museum und historische Käserei der Promotion Bellelay SA, Bellelay
- Museum der Waffen und der alten Gebrauchsgegenstände, Sonvillier
Historische Waffensammlungen (Munition, schweres und leichtes Geschütz, Pistolen, Messer, Bajonette, Säbel), Eisenbahner-, Militär- und Polizeimützen (auch aus dem Ausland), Abzeichen, Jagdutensilien, Eisenbahnlaternen etc. Das Museum wurde von Arnold Summermatter gegründet und 1993 eröffnet
- Martinet (Hammerwerk) von Corcelles
- Rebbaumuseum am Bielersee, Ligerz
- Historisches Museum von La Neuveville
- Musée jurassien des Arts, Moutier
- Museum der automatischen Drehmaschine und der Geschichte, Moutier
- Maison des Sarrasins, Orvin
Haus aus dem Jahr 1602 im alten Dorfkern als Zeuge des Lebens von früher.
- Longines-Museum, Saint-Imier
Das Museum wurde 1992 in den Gebäuden der Firma Longines in Saint-Imier eröffnet.
- Museum von Saint-Imier
- Mineralienmuseum, Saint-Imier


BIEL

- Museum Schwab
- Museum Neuhaus
- Centre PasquArt
- Centre Müller
- Optisches Museum
- Omega Museum


LAUFENTAL

- Museum Laufental, Laufen
- Ortsmuseum Liesberg, Liesberg
Das Museum zeigt vorwiegend sakrale Kunst des Barock und des 19. Jh. aus Liesberg, daneben auch Wappen und Gemälde, Dokumente zur Bistumsgeschichte, Uniformen der Schweizergarde, Münzen etc.